معایب اصلی شیرهای پروانه ای افست سه گانه عبارتند از:
- هزینه بالاتر در مقایسه با انواع شیرهای ساده تر
- مناسب بودن محدود برای سیستم های کم فشار
- نصب و نگهداری مجتمع
- نیاز به حذف از لوله برای تعمیرات داخلی
- برای برخی شرایط دما/فشار شدید ایده آل نیست
- نیازهای تعمیر و نگهداری بالاتر به دلیل طراحی پیچیده
با وجود این اشکالات، آب بندی و عملکرد برتر آنها در کاربردهای فشار/دمای بالا اغلب در موارد استفاده مناسب از این معایب بیشتر است.